Обучение будет осуществляться по целевым направлениям, которые будущие специалисты получили в департаменте здравоохранения ЕАО.
В университете будут готовить врачей по следующим специальностям: акушерство и гинекология, анестезиология-реаниматология, клиническая лабораторная диагностика, рентгенология, функциональная диагностика, психиатрия, инфекционные болезни, неврология, терапия, фтизиатрия, эндокринология, онкология, оториноларингология, офтальмология, травмотология и ортопедия, хирургия, стоматология ортопедическая, стоматология детская.
По условиям заключённого с департаментом здравоохранения ЕАО договором на целевое обучение, будущие врачи обязаны будут вернуться в область и отработать в государственных медучреждениях определённый срок.